对于萎缩性胃炎的人来说，首先建议进行幽门螺杆菌的检测；对于幽门螺杆菌阳性的人来说应积极除菌治疗。通过根除幽门螺杆菌治疗能延缓萎缩的进展。
目前常采用四联除菌疗法，包括两种抗生素，一种质子泵抑制剂和一种铋剂。其中抗生素可以选择：阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑或者四环素、呋喃唑酮；铋剂可以选择：胶体果胶铋或者胶体酒石酸铋；质子泵抑制剂可以选择：雷贝拉唑，奥美拉唑或者兰索拉唑等。服药疗程为10天到14天，停药28天后复查了解感染的根除情况。
此外，对于萎缩性胃炎的人来说应定期复查胃镜以及病理活检，了解粘膜的萎缩情况，萎缩程度是否伴有肠上皮化生。对于重度的肠上皮化生则更需重视，必要时需行内镜下的治疗。
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